Jezioro Charzykowskie położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 1363.8 ha oraz objętość wód szacowaną na 134533.2 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20290 (nr katalogowy 20290).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.4643°N, 17.3009°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako dobry, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 288 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 3.3 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.4%, stężenie azotu ogólnego 0.85 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.093 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 9.5 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 1.06, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.427, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.603, Jeziorowy Indeks Rybny LFI-CEN 0.47.
Pod względem powierzchni to 4. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.