Jezioro Chomiąskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 102.2 ha oraz objętość wód szacowaną na 9960.8 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW10444 (nr katalogowy 10444).
Jezioro leży w region wodny Warty, w obszarze dorzecza Odry, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.4529°N, 17.5001°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2009 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 681 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 2.5 m, stężenie azotu ogólnego 0.86 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.073 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 18 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik makrofitowy ESMI 0.526.
Pod względem powierzchni to 56. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2009 r., czyli 17 lat temu.