Jezioro Lipczyno Wielkie położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 155 ha oraz objętość wód szacowaną na 13927.8 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20282 (nr katalogowy 20282).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.5344°N, 17.1522°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 230 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 5.6 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.8%, stężenie azotu ogólnego 0.64 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.023 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 4.5 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0.63, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.657.
Pod względem powierzchni to 40. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.