Jezioro Mełno położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 155.2 ha oraz objętość wód szacowaną na 6745.7 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20610 (nr katalogowy 20610).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.2654°N, 19.0056°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 503 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.5 m, zawartość tlenu nad dnem 0 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 1.65 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.12 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 30.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.07, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.385, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.662.
Pod względem powierzchni to 30. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.