Jezioro Nidzkie położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 1818 ha oraz objętość wód szacowaną na 113872.3 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30179 (nr katalogowy 30179).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.3438°N, 21.3231°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako zły, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 179 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.1 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0%, stężenie azotu ogólnego 1.34 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.076 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 34.8 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 4.65, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.399, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.734.
Pod względem powierzchni to 8. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: turystyka i rekreacja, zasilanie wewnętrzne.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.