Jezioro Niedzięgiel położone jest w województwie wielkopolskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 550.9 ha oraz objętość wód szacowaną na 30089.9 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW10409 (nr katalogowy 10409).
Jezioro leży w region wodny Warty, w obszarze dorzecza Odry, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Poznań. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.2701°N, 17.5425°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 582 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 5.8 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0%, stężenie azotu ogólnego 1.15 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.022 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 3.2 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.833, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.62.
Pod względem powierzchni to 3. co do wielkości jezioro w województwie wielkopolskie spośród 129 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja, presja chemiczna (substancje priorytetowe).
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.