Jezioro Święcajty położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest silnie zmienioną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 869.4 ha oraz objętość wód szacowaną na 76367.5 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30545 (nr katalogowy 30545).

Jezioro leży w region wodny Łyny i Węgorapy, w obszarze dorzecza Pregoły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.1045°N, 21.4608°E.

Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.

Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 248 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.6 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.8%, stężenie azotu ogólnego 1.06 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.03 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 15.7 µg/l.

Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.73, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.394, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.804.

Pod względem powierzchni to 22. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.

Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.

Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.