Jezioro Borzyszkowskie położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 101.2 ha oraz objętość wód szacowaną na 8076.2 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20313 (nr katalogowy 20313).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.0150°N, 17.2216°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako dobry, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 196 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 3.9 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 1.1%, stężenie azotu ogólnego 1.06 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.011 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 6.5 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0.95, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.908, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.612.
Pod względem powierzchni to 71. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.