Jezioro Boruja Duża położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 65.1 ha oraz objętość wód szacowaną na 3335.1 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20987 (nr katalogowy 20987).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.0532°N, 17.2620°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako dobry, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 123 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 2.6 m, zawartość tlenu nad dnem 0 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 1.03 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.021 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 11.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 1.01, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.614.
Pod względem powierzchni to 114. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.