Jezioro Czarmuńskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 61.6 ha oraz objętość wód szacowaną na 1642.6 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW10504 (nr katalogowy 10504).
Jezioro leży w region wodny Warty, w obszarze dorzecza Odry, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.1744°N, 17.2733°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako słaby, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 549 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.7 m, zawartość tlenu nad dnem 3.6 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 2.08 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.107 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 57.6 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 3.42, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.141, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.686.
Pod względem powierzchni to 95. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.