Jezioro Gołdap położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 149 ha oraz objętość wód szacowaną na 8345.3 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30576 (nr katalogowy 30576).
Jezioro leży w region wodny Łyny i Węgorapy, w obszarze dorzecza Pregoły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.1955°N, 22.2008°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 298 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.1 m, zawartość tlenu nad dnem 0 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 1.47 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.057 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 32.2 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.15, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.219, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.759.
Pod względem powierzchni to 155. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.