Jezioro Jegocin położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 127.4 ha oraz objętość wód szacowaną na 11439.7 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30265 (nr katalogowy 30265).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.4003°N, 21.4126°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2015 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako bardzo dobry, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 162 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 5.7 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 1.3%, stężenie azotu ogólnego 0.8 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.009 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 3.4 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.684, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.906, Jeziorowy Indeks Rybny LFI-CEN 0.78.
Pod względem powierzchni to 168. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2015 r., czyli 11 lat temu.