Jezioro Limajno położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 232.9 ha oraz objętość wód szacowaną na 22460.8 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30461 (nr katalogowy 30461).
Jezioro leży w region wodny Łyny i Węgorapy, w obszarze dorzecza Pregoły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.5532°N, 20.2152°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2005 r.) stan/potencjał ekologiczny określono jako bardzo dobry.
Pod względem powierzchni to 91. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2005 r., czyli 21 lat temu.