Jezioro Sunia położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 111.6 ha oraz objętość wód szacowaną na 4428 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30463 (nr katalogowy 30463).
Jezioro leży w region wodny Łyny i Węgorapy, w obszarze dorzecza Pregoły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.5731°N, 20.1715°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2010 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 309 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.5 m, zawartość tlenu nad dnem 0.1 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 0.83 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.048 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 17.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 1.59, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.347, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.832.
Pod względem powierzchni to 185. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2010 r., czyli 16 lat temu.