Jezioro Niskie Brodno położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 87.2 ha oraz objętość wód szacowaną na 6045.7 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20197 (nr katalogowy 20197).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.1651°N, 19.2249°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako słaby, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 362 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.1 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0%, stężenie azotu ogólnego 1.39 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.071 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 22.1 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 3.29, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.511, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.618.
Pod względem powierzchni to 64. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.