Jezioro Rekąty położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 53.4 ha oraz objętość wód szacowaną na 1232.2 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30104 (nr katalogowy 30104).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.5458°N, 22.1060°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako słaby, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 322 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.9 m, zawartość tlenu nad dnem 0.3 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 1.45 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.088 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 41 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 3.29, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.331, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.795.
Pod względem powierzchni to 296. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.