Jezioro Skanda położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 51.1 ha oraz objętość wód szacowaną na 2963.8 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30447 (nr katalogowy 30447).
Jezioro leży w region wodny Łyny i Węgorapy, w obszarze dorzecza Pregoły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.4518°N, 20.3149°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako zły, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 320 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.1 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 1.2%, stężenie azotu ogólnego 1.37 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.054 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 37.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 4.49, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.294, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.842.
Pod względem powierzchni to 303. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.