Jezioro Skotawsko Wielkie położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 80 ha oraz objętość wód szacowaną na 3278 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW21000 (nr katalogowy 21000).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.1630°N, 17.3243°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 213 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.6 m, zawartość tlenu nad dnem 0.1 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 0.78 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.047 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 56.5 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.31, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.305, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.526.
Pod względem powierzchni to 85. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.