Jezioro Wądzyńskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 170.4 ha oraz objętość wód szacowaną na 13270.5 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20599 (nr katalogowy 20599).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 53.1914°N, 19.1431°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2011 r.) stan/potencjał ekologiczny określono jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 423 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 2.1 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0%, stężenie azotu ogólnego 1.69 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.043 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 16.9 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 1.68, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.632, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.82.
Pod względem powierzchni to 24. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2011 r., czyli 15 lat temu.