Jezioro Węgorzyno położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 124.2 ha oraz objętość wód szacowaną na 6189.6 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20962 (nr katalogowy 20962).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.1432°N, 17.4729°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 262 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.8 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.2%, stężenie azotu ogólnego 0.95 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.051 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 31.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.97, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.421, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.747, Jeziorowy Indeks Rybny LFI-CEN 0.53.
Pod względem powierzchni to 58. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.