Jezioro Garczyno położone jest w województwie pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 113.4 ha oraz objętość wód szacowaną na 5469.1 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20481 (nr katalogowy 20481).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Gdańsk. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.0717°N, 17.5349°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 236 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.1 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.3%, stężenie azotu ogólnego 1.08 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.166 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 31.6 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.67.
Pod względem powierzchni to 64. co do wielkości jezioro w województwie pomorskie spośród 152 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.