Jezioro Kubek położone jest w województwie wielkopolskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 68.8 ha oraz objętość wód szacowaną na 1389.4 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW10286 (nr katalogowy 10286).
Jezioro leży w region wodny Warty, w obszarze dorzecza Odry, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Poznań. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.4154°N, 16.0418°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako słaby, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 335 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 1.2 m, zawartość tlenu nad dnem 6.2 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 2.08 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.211 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 38.1 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 3.13, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.631, Jeziorowy Indeks Rybny LFI-CEN 0.62.
Pod względem powierzchni to 99. co do wielkości jezioro w województwie wielkopolskie spośród 129 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.