Jezioro Lubieńskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 89 ha oraz objętość wód szacowaną na 3494.7 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20049 (nr katalogowy 20049).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.2335°N, 19.1112°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako zły, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 415 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.7 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0.2%, stężenie azotu ogólnego 2.26 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.147 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 59.5 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 4.32, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.135, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.503.
Pod względem powierzchni to 63. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, zasilanie wewnętrzne.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.