Jezioro Rakutowskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 300.5 ha oraz objętość wód szacowaną na 3228.5 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW20059 (nr katalogowy 20059).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.3151°N, 19.1349°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2013 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako dobry, a stan/potencjał ekologiczny określono jako bardzo dobry, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 474 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 2 m, zawartość tlenu nad dnem 7 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 1.18 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.12 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 4.6 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0.2, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.756, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.558.
Pod względem powierzchni to 6. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2013 r., czyli 13 lat temu.