Jezioro Modzerowskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 231.7 ha oraz objętość wód szacowaną na 7729.4 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW10389 (nr katalogowy 10389).
Jezioro leży w region wodny Warty, w obszarze dorzecza Odry, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Bydgoszcz. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 52.2154°N, 18.4606°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2012 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 525 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.6 m, zawartość tlenu nad dnem 0.8 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 2.28 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.083 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 76.6 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 2.99, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.206, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.675.
Pod względem powierzchni to 14. co do wielkości jezioro w województwie kujawsko-pomorskie spośród 124 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2012 r., czyli 14 lat temu.