Jezioro Zagłębocze położone jest w województwie lubelskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 59 ha oraz objętość wód szacowaną na 4279 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30698 (nr katalogowy 30698).
Jezioro leży w region wodny Środkowej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Lublin. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 51.2551°N, 23.0124°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2011 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako umiarkowany, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 196 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 2.2 m, nasycenie tlenem hypolimnionu 0%, stężenie azotu ogólnego 1.3 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.004 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 7.7 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 0.88, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.626, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.66.
Pod względem powierzchni to 14. co do wielkości jezioro w województwie lubelskie spośród 17 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną, turystyka i rekreacja.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2011 r., czyli 15 lat temu.