Jezioro Tonka położone jest w województwie warmińsko-mazurskie i zgodnie z klasyfikacją Jednolitych Części Wód Powierzchniowych (JCWP) jest naturalną częścią wód. Zbiornik ma powierzchnię 162.3 ha oraz objętość wód szacowaną na 3701.6 tys. m³. W ewidencji wód jezioro figuruje pod kodem JCWP PLLW30361 (nr katalogowy 30361).
Jezioro leży w region wodny Dolnej Wisły, w obszarze dorzecza Wisły, a badania monitoringowe prowadzi Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Olsztyn. Współrzędne geograficzne jeziora to w przybliżeniu 54.0215°N, 20.1307°E.
Zgodnie z oceną Państwowego Monitoringu Środowiska (badania z 2014 r.) ogólny stan tej części wód oceniono jako zły, a stan/potencjał ekologiczny określono jako słaby, a stan chemiczny jako dobry.
Z pomiarów fizykochemicznych wynika, że przewodność elektrolityczna właściwa wynosiła 280 µS/cm, przezroczystość wody (widzialność krążka Secchiego) 0.5 m, zawartość tlenu nad dnem 4 mgO₂/l, stężenie azotu ogólnego 2.12 mgN/l, stężenie fosforu ogólnego 0.059 mgP/l, stężenie chlorofilu „a” 63.9 µg/l.
Badania elementów biologicznych wykazały, że wskaźnik fitoplanktonowy PMPL wyniósł 3.96, wskaźnik makrofitowy ESMI 0.359, indeks okrzemkowy fitobentosu IOJ 0.7.
Pod względem powierzchni to 142. co do wielkości jezioro w województwie warmińsko-mazurskie spośród 311 zbadanych.
Jako prawdopodobne przyczyny obniżonego stanu wód wskazuje się: rolnictwo z zabudową rozproszoną.
Ostatnie badania jakości wody przeprowadzono w 2014 r., czyli 12 lat temu.